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infectious diseases

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Les maladies infectieuses représentent un défi constant pour la santé publique, touchant des communautés à travers le monde avec une rapidité parfois déconcertante. Ce domaine étudie comment les pathogènes, qu'il s'agisse de virus, de bactéries ou de parasites, se propagent et affectent nos organismes, tout en explorant les stratégies pour les combattre et prévenir leurs épidémies.

Sur Gist.Science, nous parcourons systématiquement les nouveaux prépublications hébergées sur medRxiv consacrées à ces sujets. Pour chaque article, nous générons deux versions de résumé : une explication claire et accessible pour le grand public, et une analyse technique détaillée pour les experts. Cette approche dualiste permet à chacun de comprendre l'essentiel de la recherche en cours sans être submergé par le jargon spécialisé.

Voici la sélection des dernières publications dans ce domaine, directement issues de medRxiv et traitées pour vous offrir une vue d'ensemble immédiate.

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Types, Subtypes and Positivity Rates of Seasonal Influenza in Uganda, 2019-2023

Cette étude analyse les données sur la grippe saisonnière en Ouganda entre 2019 et 2023, révélant un taux de positivité global de 5 % avec des pics bimodaux, une prévalence plus élevée chez les hommes et les enfants âgés de 5 à 9 ans, ainsi qu'une prédominance de l'Influenza A (spécifiquement H3N2) qui a diminué au fil du temps, soulignant la nécessité d'une surveillance soutenue et d'interventions ciblées.

Nankya, M. A., Owor, N., Kayiwa, J. T., Lutwama, J. J., Gidudu, S., Bahizi, G., Ario, A. R.2026-09-01
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Clinical evaluation of artificial intelligence for diagnostics of antibiotic-resistant bacteria

Cette étude a évalué de manière prospective un modèle d'IA entraîné sur des données de surveillance européennes pour prédire la sensibilité aux antibiotiques dans les isolats urinaires cliniques d'*E. coli*, concluant que, bien que le modèle présente des performances prometteuses, son utilité clinique est actuellement limitée par des taux d'erreur importants et la nécessité de données diagnostiques supplémentaires au-delà des résultats standards de sensibilité et de démographie.

Hessel, M., Inda Diaz, J. S., Sjöberg, A., Salva-Serra, F., Helldal, L., Jirstrand, M., Johnning, A., Kristiansson, E. (…)2026-08-31
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Characterizing the Burden of Scrub Typhus in Nepalese Children using Representative School-Based Cross-Sectional Serosurveys

Cette étude a utilisé des enquêtes sérologiques scolaires représentatives au Népal pour révéler une charge substantielle de la rickettsiose de type scrub typhus chez les enfants, caractérisée par une séroincidence globale de 6,3 nouvelles infections pour 1 000 personnes-années qui augmente avec l'âge et est plus élevée chez les filles.

Naga, S. R., Shahi, S. B., Gosai, S., Maharjan, M., Katuwal, N., Morrison, E., Andrews, J., Shrestha, R., Tamrakar, D. (…)2026-08-31
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INTerrupting prolifERation of Carbapenem resistance in Indonesia: clinical and genomic Evaluation of Pathways of Transmission (INTERCEPT) : a Study Protocol

Le protocole de l'étude INTERCEPT décrit une collaboration multidisciplinaire entre le Royaume-Uni et l'Indonésie qui intègre la surveillance génomique, la modélisation mathématique et la recherche qualitative à travers le centre de Java afin d'identifier les voies de transmission des bactéries résistantes aux carbapénèmes et de co-concevoir des interventions contextuelles spécifiques pour interrompre leur propagation.

Farida, H., Hapsari, R., Lestari, E. S., Farhanah, N., Roberts, A. P., Graf, F. E., Dacombe, R. E., Moore, M. E., Lewis (…)2026-08-31
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Clinical features of COVID-19 patients hospitalized at the Tashkent State Medical University and risk factors for intensive care unit admission: a cross-sectional study from Uzbekistan, Central Asia

Cette étude transversale portant sur 2 500 patients hospitalisés pour la COVID-19 en Ouzbékistan caractérise les caractéristiques cliniques de la première vague pandémique en Asie centrale et identifie l'âge avancé, les comorbidités cardiométaboliques et l'atteinte respiratoire comme des prédicteurs indépendants clés d'une admission en unité de soins intensifs.

Rakhimov, B., Choi, J., Kim, K., Tuychiev, L., Shadmanov, A., Mamatkulov, B.2026-08-31
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Suspected mpox admissions to a dedicated infectious-diseases isolation ward in northeastern Nigeria, 2022-2025: a register-based descriptive study with evidence of a household cluster

Cette étude descriptive basée sur des registres portant sur 15 admissions suspectes de mpox dans un hôpital du nord-est du Nigeria entre 2022 et 2025 a identifié un important foyer domestique et un taux de létalité de 20 %, soulignant le besoin urgent de renforcer le diagnostic de laboratoire et l'enregistrement obligatoire des résultats pour améliorer la précision de la surveillance.

Ahmad, H., Hayatu, A.2026-08-28
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Quantifying Blood Culture Volume Using an Automated System: Insights from Pediatric and Adult Simulated Collections Using BACTEC FXI

Cette étude démontre que la cellule de charge intégrée du système de culture BD BACTEC FXI quantifie avec précision les volumes sanguins dans des collectes simulées pédiatriques et adultes, avec des erreurs moyennes de -0,03 mL par flacon et de -0,08 mL par patient, confirmant son utilité pour la surveillance automatisée du volume sanguin.

Turner, D., Herr, J.2026-08-25
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Diagnostic performance of Xpert MTB/RIF Ultra assay for tuberculosis in stool specimens among adult presumptive TB patients in a generalized HIV epidemic setting

Dans une étude prospective portant sur des patients adultes présumés tuberculeux à la frontière entre la Thaïlande et le Myanmar, l'essai Xpert MTB/RIF Ultra réalisé sur des échantillons de selles a démontré une sensibilité élevée (90,32 %) et une spécificité (98,78 %) comparables à celles du test de l'expectoratif, soutenant ainsi son utilisation comme méthode de diagnostic viable lorsqu'il est impossible d'obtenir des échantillons respiratoires.

Aung, H. K. K., Thi, S. S., Watthanaworawit, W., Phyo, A. P., Nosten, F. H.2026-08-24
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Patterns and Trends of Antimicrobial Resistance of WHO Bacterial Priority Pathogens in Kenya: data from multi-site surveillance for the period 2021-2025

Sur la base de données de surveillance multisites de 2021 à 2025, cette étude révèle des tendances alarmantes et croissantes de la résistance aux antimicrobiens parmi les agents pathogènes prioritaires de l'OMS au Kenya, soulignant particulièrement les taux élevés de *Klebsiella pneumoniae* résistante aux carbapénèmes et de *Staphylococcus aureus* résistant à la méthicilline, ce qui souligne la nécessité urgente de renforcer le contrôle des infections et la gestion des antimicrobiens.

Kassim, A., Ombajo, L. A., Njeru, J., Githii, S., Matheka, C., Andrew, J., Otieno, E., Kariuki, N., Kiigu, F., Mburu, V. (…)2026-08-21
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The magnitude of early hepatitis B RNA and DNA declines directly inform capsid assembly modulator effectiveness

Cette étude démontre que l'ampleur des baisses précoces des taux d'ARN et d'ADN de l'hépatite B au cours des deux premières semaines d'un traitement par modulateur de l'assemblage de la capside peut être utilisée pour estimer avec précision l'efficacité antivirale in vivo de ces médicaments, fournissant ainsi une méthode rapide pour évaluer les nouveaux traitements et minimiser le risque de résistance médicamenteuse lors des essais cliniques.

Cassidy, T., Iyaniwura, S. A., Ribeiro, R. M., Perelson, A. S.2026-08-21